Tegucigalpa fue fundada por un grupo de españoles con el nombre de Real Villa de San Miguel de Tegucigalpa de Heredia el 29 de septiembre de 1578 sobre un antiguo poblado indígena existente. En ese época el área de Tegucigalpa era un centro de actividad minera donde se extraía especialmente plata y oro.

Durante todo el período colonial la aldea tuvo un carácter minero, extrayéndose minerales desde el cerro El Picacho y en la zona montañosa de San Juancito. Al devenir la independencia del país la capitalidad de la República de Honduras pasó de Tegucigalpa a Comayagua y viceversa en varias ocasiones, hasta que en 1880 quedó definitivamente establecida en Tegucigalpa.

Una universidad fue fundada en 1847 con el nombre de "La Sociedad del Genio Emprendedor y del Buen Gusto", siendo su primer rector el sacerdote José Trinidad Reyes. Cabe señalar que el Museo Nacional tiene una colección notable de objetos precolombinos. En la década de los años treinta se incorporó a la ciudad el entonces pueblo de Comayagüela (al otro lado del río Choluteca).

Tegucigalpa ha crecido en los últimos 50 años, pero se ha convertido en una ciudad desorganizada debido a la falta de planificación de la misma. La migración campo-ciudad ha venido a incrementar la población capitalina. Los terrenos aledaños, especialmente ubicados en las laderas de los numerosos cerros, muchos carentes de urbanización.

Tegucigalpa esta comunicada con el resto del país y el exterior por diversas carreteras pavimentadas, aunque mal mantenidas. La principal de ellas se dirige hacia el norte del país, otra hacia el sur -conectando con la Carretera Interamericana- y una tercera hacia el este. La ciudad cuenta con un aeropuerto internacional (Toncontin) en el sector sur, atendido por compañías aéreas internacionales como American Airlines, Continental Airlines, TACA y varias líneas aéreas locales, que la conectan con el resto del país, El Salvador y Estados Unidos.

Huracán Mitch

El 30 de octubre de 1998 la ciudad sufrió daños importantes tras el paso del huracán Mitch, que destruyó una parte de Comayagüela y los lugares bordeados por el río Grande o Choluteca. El huracán se mantuvo sobre el territorio hondureño por cinco días lo que ocasionó que la tierra no pudiera absorber tanta lluvia y aunado a la deforestación] provocará graves inundaciones en todo el país, principalmente en Tegucigalpa.

 

Limpieza Luego de que Mitch Azotara Tegucigalpa.

La crecida de los afluentes del río Grande o Choluteca hicieron que éste rebasará la altura del puente Mallol, el cual fue arrastrado por la corriente. Las lluvias también provocaron deslizamientos de tierra en el sector del cerro El Berrinche. Estos deslizamientos arrastraron la mayor parte de la colonia Soto, cuyos escombros cayeron sobre la cuenca del río haciendo que se formara un dique a la altura de dicha colonia, este dique estancó las aguas del río Grande o Choluteca y ocasionó la inundación en las partes bajas de Comayagüela destruyendo los viejos establecimientos ubicados a inmediaciones de la Calle Real. En otros sectores la corriente derrumbó colinas, cerros, y laderas de montañas, llevando consigo barrios enteros, edificios, parques, automóviles, etc.

Tegucigalpa a tenido un crecimiento grandisimo en edificios y condominios. Es una de las ciudades de centroamerica que mas crece.